Implementere APT - modellen i CellML og tilhørende simuleringsverktøy.

Abstract

Oppgaven tar for seg et raskt overblikk over APT - modellen implementert i MatLab. Før den går inn på egenskaper ved CellML. Hvordan et CellML - dokument skal bygges opp. Det er introdusert noen standard softwares for å behandle CellML - filer så effektivt som mulig, dette er da snakk om OpenCOR. Videre er perifer - programmer og noen av dets egenskaper nevnt som et alternativ til OpenCOR's begrensninger.

Deretter er ideen om å oversette CellML til andre mer sekvensielle språk som Pyhton, otrodusert. Her går man gjennom mulighetene og begrensningene ved en slik transformasjon. Ser også på mulighetene til å benytte Python - lib for behandling av data og simuleringer. Går inn på hvorfor dette er et bra alternativ ved enkelte begrensninger knyttet til CellML.

En god gjennomgang av SED - ML er også gjort. Hvorfor et slik språk har en så stor framtid både som informasjonsbærer men også som et rent simuleringsverktøy.

Til slutt er også ideer rundt behandling av simuleringsinput og bruk av regulatorer itnrodusert