Microbial quality of the copepod Acartia tonsa for use as live feed for marine larvae: A process-evaluation
Master thesis
Permanent lenke
https://hdl.handle.net/11250/2782572Utgivelsesdato
2020Metadata
Vis full innførselSamlinger
Sammendrag
Copepoder har vist seg å være et godt levendefôr-alternativ for marine larver. Overlegent sammenlignet med mer tradisjonelt levendefôr, som Arteima og rotatorier. Dette gjør copepoder til en viktig fôrkilde innenfor akvakultur. Den samme utfordringen som ved andre levendefôr-kilder er likevel tilstede, i form av risiko for overføring av patogener. Her har jeg vurdert den mikrobielle kvaliteten i produksjonsprosessen av copepoden Acartia tonsa. Ved hjelp av de kvantitative målene total cellekonsentrasjon og CFU, samt de kvalitative målene av celler med høyt RNA-innhold, vekstpotensiale og rasktvoksende mikrober, har den mikrobielle kvaliteten blitt vurdert med grunnlag i r- og K-teorien. Hemolytisk aktivitet og taksonomi ble brukt til å bestemme risikoen for patogener tilstede i prosessen. Mikrobielt cellebidrag fra delprosesser ble også estimert. Mikrobielt samfunnsmangfold ble vurdert, både ved hjelp av fenotypiske og genotypiske fingerprinting-metoder. Vannet assosiert med copepodene ble funnet til å være ustabilt og seleksjonsregimet så ut til å sakte skifte fra r- til K-seleksjon. Det ble imidlertid ikke observert noen stabilisering av mikrobiell vannkvalitet gjennom produksjonssyklusen. Inn-vannet ble vurdert til å ha den lite gunstige seleksjonen for r-strateger, mens algereservoiret hadde mer gunstig K-seleksjon. Siden sistnevnte sto for 97-99% av det mikrobielle cellebidraget, ble inn-vannet vurdert som mindre viktig. På grunn av begrensende analysemetoder kunne ikke seleksjonsregimet til copepodene bestemmes. Ingen hemolytisk aktivitet ble funnet i produksjonsprosessen. Bakterieslektene Flavobacterium og Tenacibaculum, assosiert med fiskepatogener, ble funnet for A. tonsa og vannet assosiert med copepodene. Fraværet av hemolytisk aktivitet gjorde imidlertid at copepodene ble vurdert til å ha en høy kvalitet som levendefôr for marine larver. Copepods have been found to be a superior live feed for marine larvae compared to more traditional feed like Artemia and rotifers. This makes them an important food source in aquaculture. However, like every other live feed option, the risk of pathogen transfer to the marine larvae is present. Here, the microbial quality in the process of rearing the copepod Acartia tonsa was assessed. Using the quantitative measures of total cell concentration and CFU, as well as the qualitative measures of high RNA content, growth potential and fast growing microbes, the microbial quality has been assessed based on r- and K-theory. Haemolytic activity and taxonomy were used to determine the risk of pathogens within the process, and bacterial cell contribution from sub-processes was estimated. Microbial community diversity was assessed, using both phenotypic- and genotypic fingerprinting methods. It was found that the water associated with copepod rearing had an unstable and undetermined selection regime, shifting from r selection to K-selection. But without reaching a stable microbial water quality through the production cycle. The inn-water had an unfavorable selection regime (r-selection), while the algae reservoir had more favorable K-selection. As the latter contributed to the copepod water with 97-99% of the supplied microbial cells, the selection regime of the inn-water was deemed less important. Due to limiting analysis methods, the selection regime of the copepods could not be safely determined. No heamolytic activity was discovered within the process. The fish pathogen associated genera Flavobacterium and Tenacibaculum were discovered for A. tonsa and associated water. However, the absence of haemolytic activity lead to the conclusion that the copepods were a good quality live feed choice for marine larvae.