• norsk
    • English
  • norsk 
    • norsk
    • English
  • Logg inn
Vis innførsel 
  •   Hjem
  • Øvrige samlinger
  • Publikasjoner fra CRIStin - NTNU
  • Vis innførsel
  •   Hjem
  • Øvrige samlinger
  • Publikasjoner fra CRIStin - NTNU
  • Vis innførsel
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

PyRETIS: A well-done, medium-sized python library for rare events

Lervik, Anders; Riccardi, Enrico; van Erp, Titus Sebastiaan
Journal article
Submitted version
Thumbnail
Åpne
JCC_pyretis.pdf (3.806Mb)
Permanent lenke
http://hdl.handle.net/11250/2481054
Utgivelsesdato
2017
Metadata
Vis full innførsel
Samlinger
  • Institutt for kjemi [782]
  • Publikasjoner fra CRIStin - NTNU [19694]
Originalversjon
Journal of Computational Chemistry. 2017, 38 (28), 2439-2451.   10.1002/jcc.24900
Sammendrag
Transition Path Sampling techniques are becoming common approaches in the study of rare events at the molecular scale. More efficient methods, such as transition interface sampling (TIS) and replica exchange transition interface sampling (RETIS), allow the investigation of rare events, e.g. chemical reactions and structural/morphological transitions, in a reasonable computational time. Here, we present pyretis, a Python library for performing TIS and RETIS simulations. pyretis directs molecular dynamics (MD) simulations in order to sample rare events with unbiased dynamics. pyretis is designed to be easily interfaced with any molecular simulation package and in the present release, it has been interfaced with GROMACS and CP2K, for classical and ab initio MD simulations, respectively.
Utgiver
Wiley
Tidsskrift
Journal of Computational Chemistry

Kontakt oss | Gi tilbakemelding

Personvernerklæring
DSpace software copyright © 2002-2019  DuraSpace

Levert av  Unit
 

 

Bla i

Hele arkivetDelarkiv og samlingerUtgivelsesdatoForfattereTitlerEmneordDokumenttyperTidsskrifterDenne samlingenUtgivelsesdatoForfattereTitlerEmneordDokumenttyperTidsskrifter

Min side

Logg inn

Statistikk

Besøksstatistikk

Kontakt oss | Gi tilbakemelding

Personvernerklæring
DSpace software copyright © 2002-2019  DuraSpace

Levert av  Unit