Etablering av PCR analyser til fenotyping av Escherichia Coli

Abstract

Formålet med denne oppgaven er å optimalisere to PCR metoder, for å kunne skille mellom ulike typer E. coli. Metodene er etablert men de har ikke vært 100% spesifikk frem til nå (1, 2, 3). Vår hensikt er å kunne etablere disse metodene her på laboratoriet ved NTNU Ålesund. E. coli ble kultivert fra råvann og DNA ble isolert ved hjelp av DNeasy blood & tissue kit. Disse prøvene ble analysert ved ulike PCR-metoder. Prøvene ble visualisert ved hjelp av gelelektroforese. Den beste sammensetningen ble temperaturoptimalisert og vi har skrevet tre prosedyrer på bakgrunn av resultatene.