Etablering av PCR analyser til fenotyping av Escherichia Coli
Abstract
Formålet med denne oppgaven er å optimalisere to PCR metoder, for å kunne skille
mellom ulike typer E. coli. Metodene er etablert men de har ikke vært 100% spesifikk frem
til nå (1, 2, 3). Vår hensikt er å kunne etablere disse metodene her på laboratoriet ved
NTNU Ålesund.
E. coli ble kultivert fra råvann og DNA ble isolert ved hjelp av DNeasy blood & tissue kit.
Disse prøvene ble analysert ved ulike PCR-metoder. Prøvene ble visualisert ved hjelp av
gelelektroforese. Den beste sammensetningen ble temperaturoptimalisert og vi har skrevet
tre prosedyrer på bakgrunn av resultatene.