Vis enkel innførsel

dc.contributor.advisorLind Kroknes, Marthe
dc.contributor.advisorHusby, Alexander
dc.contributor.advisorAfset, Jan Egil
dc.contributor.advisorHaugum, Kjersti
dc.contributor.advisorNergård Valle, Siri Beate
dc.contributor.authorWiik, Kristine
dc.contributor.authorHerstad Sørensen, Tonje
dc.date.accessioned2022-07-05T17:22:00Z
dc.date.available2022-07-05T17:22:00Z
dc.date.issued2022
dc.identifierno.ntnu:inspera:106147449:107341417
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11250/3002905
dc.description.abstractAntibiotikaresistens i form av karbapenemaseproduksjon i Gram-negative bakterier er en økende helseutfordring på verdensbasis. Plasmidmedierte karbapenemasegener gir økt spredningspotensiale, og spres raskt til og mellom klinisk viktige Gram-negative bakterier. Bachelorprosjektet ble utført i regi av avdeling for medisinsk mikrobiologi ved St. Olavs hospital, og hadde som hensikt å undersøke og evaluere MBT STAR-Carba kittets evne til å detektere karbapenemaseproduksjon i Gram-negative bakterier. Metoden vil, dersom denne tas i bruk, kunne bidra i avdelingens arbeid med å raskt bekrefte/avkrefte eventuell karbapenemaseproduksjon i klinisk viktige Gram-negative bakterier. Resultater for eventuell karbapenemaseproduksjon/karbapenemasegener i 35 utdelte bakterieisolater ble opparbeidet ved bruk av metodene fenotypisk lappediffusjon, PCR og O.K.N.V.I. Resist-5 og sammenlignet med resultater oppnådd av de samme bakterieisolatene ved bruk av MBT STAR-Carba. MBT STAR-Carba detekterte karbapenemaseproduksjon i alle de 23 bakterieisolatene med kjent karbapenemaseproduksjon. Det ble også detektert hydrolyse av imipenem i fire av bakterieisolatene ved analysering med MBT STAR-Carba, selv om disse ikke hadde tidligere påvist karbapenemaseproduksjon. I tillegg forekom uoverensstemmelse mellom resultatene for fire andre prøver som kan skyldes svakheter ved de ulike anvendte metodene. Det ble konkludert med at videre tiltak er nødvendig for å kunne vurdere om MBT STAR-Carba kan tas i bruk ved avdeling for medisinsk mikrobiologi ved St. Olavs hospital. Videre tiltak bør inkludere helgenomsekvensering av bakterieisolatene hvor dette ikke var utført i forkant av bachelorprosjektet. Dette kan bidra i arbeidet med å undersøke om MBT STAR-Carba gjør feil i sin deteksjon av karbapenemaseproduksjon i Gram-negative bakterier.
dc.description.abstractCarbapenemase production in Gram negative bacteria makes antibiotic resistance an increasing global health challenge. Plasmid mediated carbapenemase genes facilitate the spread of carbapenem resistance in and between Gram negative bacteria of clinical importance. This bachelor’s project was assigned by the Department of Medical Microbiology at St. Olavs hospital in Trondheim, Norway. The project’s aim was to research and evaluate the MBT STAR-Carba kit’s ability to detect carbapenemase production in Gram negative bacteria. If evidence suggests that MBT STAR-Carba could be implemented in the laboratory, the method could help with quick confirmation or debunking of carbapenemase production in Gram negative bacteria of clinical importance. The applied methods to achieve results about the assigned bacterial isolates were agar tablet/disc diffusion method, PCR and O.K.N.V.I. Resist-5. Comparison of the results on the bacterial isolates’ status on presence or absence of carbapenemase production and carbapenemase genes were done between the previously mentioned methods and MBT STAR-Carba. MBT STAR-Carba detected carbapenemase production in all 23 bacteria isolates with known carbapenemase production. In addition, hydrolyzation of imipenem in four bacterial isolates were detected by MBT STAR-Carba, although these isolates had no previously detected carbapenemase production. Discrepancies also occured between the achieved results for four other isolates. These discrepancies may be due to weaknesses in the other applied methods. It was concluded that further efforts are necessary to properly evaluate whether MBT STAR-Carba can be implemented at the Department of Medical Microbiology at St. Olavs Hospital. Further efforts should include whole genome sequencing of the bacteria isolates where this had not been done previously to the bachelor’s project. This can contribute to the work of researching whether MBT STAR-Carba makes errors in the detection of carbapenemase production in Gram negative bacteria.
dc.languagenob
dc.publisherNTNU
dc.titleEvaluering av MBT STAR-Carba for deteksjon av karbapenemaseproduserende bakterier ved hjelp av MALDI-TOF MS
dc.typeBachelor thesis


Tilhørende fil(er)

Thumbnail

Denne innførselen finnes i følgende samling(er)

Vis enkel innførsel