Holdbarhet av metabolitter i urin

Abstract

Institutt for sirkulasjon og billedbehandling (ISB) ved NTNU og St. Olavs hospital samarbeider i et større forskningsprosjekt om å etablere en biobank med urinprøver fra friske frivillige og fra pasienter med psoriasis og psoriasisartritt. De ønsker å undersøke i hvilken grad lagringsbetingelser kan påvirke måleresultatet av metabolitter i urinprøver, noe som danner grunnlaget for denne bacheloroppgaven.

I bacheloroppgaven blir lagringsinstabilitet av metabolittene alanin, citrat, glysin, hippurate og trigonelline i urin undersøkt, samt at det blir undersøkt i hvilken grad man kan identifisere signifikante forskjeller av metabolittkonsentrasjoner mellom ulike donorgrupper. Analysen baserer seg på tidligere innhentet data. Datamaterialet består av MR-data fra urinprøver fra totalt 63 donorer. Urinprøvene var lagret i ulike tidsrom før frysing, og ble tint opp før analyse med MR-spektroskopi.

Etter inndeling i grupper ble datamaterialet analysert. Gjennomsnitt, standardavvik og variasjonskoeffisienter ble beregnet. Tosidig t-test ble brukt for å sammenligne gruppene, og p-verdier < 0,05 ble vurdert som statistisk signifikant forskjell mellom grupper.

Resultatene viste at det er statistisk signifikant forskjell mellom gruppene «kvinner» og «menn» for prøver av citrat lagret < 2 timer før frys, og at metabolittene trolig er stabile ved lagring ≥ 2 timer før frys. Det kan likevel se ut som at resultatene i stor grad er avhengig av verdiene som ble inkludert i de ulike gruppene, og at variasjoner som blir funnet mellom prøver antagelig er større enn effekter av prøvebehandling.

Department of Circulation and Medical Imaging (ISB) at NTNU and St. Olavs Hospital are collaborating in a major research project to establish a biobank with urine samples from healthy volunteers and from patients with psoriasis and psoriatic arthritis. ISB wants to investigate the extent to which storage conditions can affect the measurement result of metabolites in urine samples, which forms the basis for this bachelor’s thesis.

In this bachelor’s thesis the storage instability of the metabolites alanine, citrate, glycine, hippurate and trigonelline is examined, as well as to what extent significant differences of metabolite concentrations between groups can be identified. The assay is based on previously collected data. The data material consists of samples from the total of 63 donors. The samples have been stored for different periods of time before assay with MR spectroscopy.

After dividing the data material into groups, it was processed with calculation of averages, standard deviations, and variation coefficients. A two-tailed t-test was used to compare the groups, and a p-value < 0.05 was considered as a statistically significant difference between groups.

The results showed that there is a statistically difference between the groups “women” and “men” for samples of citrate stored < 2 hours before freezing, and that all the metabolites most likely are stabile with storage ≥ 2 hours before freezing. Yet it looks like that the results are largely dependent of the values included in the different groups, and that variations found between samples probably are bigger that the effects of sample storage.