En mekanistisk studie av funksjonelle polymorfismer i IL1B -genet

Abstract

SammendragEpidemiologiske studier har vist at personer med kronisk betennelse kan være disponert for ulike typer kreft. Det er anslått at underliggende infeksjoner og inflammatorisk respons er knyttet til 15-20 % av alle kreftdødsfall. Samtidig er lungekreft den kreftsykdommen som tar flest liv på verdensbasis, og sykdommen er ofte forbundet med eksponering for kreftfremkallende stoffer. Den største risikofaktoren for lungekreft er tobakksrøyking, og omlag 80-90 % av de som blir diagnostisert med lungekreft er eller har vært røykere. Likevel er det kun omlag 15 % av de som røyker gjennom et helt liv som utvikler lungekreft. Siden 85 % av alle røykere ikke får lungekreft, tyder det på at det foreligger en genetisk disposisjon hos de som utvikler lungekreft.IL1B er et viktig inflammatorisk gen, som inneholder en rekke SNPer som har blitt grundig studert gjennom en rekke studier. Flere av disse SNPene har vist en sammenheng med risiko for å utvikle kreft. I denne oppgaven ble promotoraktiviteten til IL1B studert med tanke på SNP T-31C. Dette ble gjort i in vitro-forsøk med humane cellelinjer, der en Luciferase reporter vektore ble co-transfektert inn i cellene, sammen med en Renilla Luciferase vektor. Promotoraktiviteten ble deretter målt i et dual-reporter assay, hvor to individuelle reporterenzymer ble uttrykt og registrert i samme forsøk. Resultatene fra disse forsøkene viste at T-varianten av T-31C SNPen ble uttrykt i høyere grad en C-varianten. Tidligere studier på den samme SNPen har gitt det samme resultatet.Også to andre SNPer, nemlig C3954T og G-3893A, ble studert i oppgaven. Ved å genotype 363 DNA-prøver fra lungekreftpasienter og 440 friske kontroller med tanke på disse to SNPene, kunne man se om det var noen økt risiko for kreft, forbundet med noen av variantene. For C3954T fant man ingen slik risiko, mens man kunne se at G-3893A hadde en beskyttende effekt mot kreft. Risikoen for å utvikle kreft hos personer med A-varianten av denne SNPen, var med andre ord lavere enn for personer som har villtypen.