Funksjonelle studier av to antatte peptid-ligander tilhørende IDA-RELATED PEPTIDE-familien i Arabidopsis thaliana (vårskrinneblom)

Abstract

IDA RELATED PEPTIDE (IRP)1 og IRP9, to antatte sekrerte peptider tilhører sammen med IRP10 den utvidede INFLORESCENCE DEFICIENT IN ABSCISSION (IDA)-genfamilien. På grunn av likheter på proteinnivå antas IRP9 å ha en overflødighetsfunksjon med IRP10 i signalspor. Funksjonene til de antatte peptidene IRP1 og IRP9 ble studert ved hjelp knockout/knockdown-mutanter, dobbelmutant og overuttrykkslinjer under ulike abiotiske og biotiske betingelser.Etter behandling med UV-B stråling økte genuttrykkene av IRP1 og IRP9 betydelig, og en mulig overflødighetsfunksjon mellom IRP1 og IRP10 ble påvist. Ved transkripsjonsanalyser av linjer som overuttrykte IRP1 ble det vist reduksjon i uttrykket av tre gener i JASMONATE ZIM-DOMAIN (JAZ)-familien og en økning i transkripsjon av det jasmonat (JA)-induserte genet PLANT DEFENSIN1.2. Videre viste en IRP1-RNAi linje økt motstand mot det bakterielle patogenet Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000, hvilket kan bety at peptidet i tillegg til en funksjon i JA-signalisering har en funksjon som signalmolekyl for en negativ regulator av salisylsignalisering.