Blar i NTNU Open på forfatter "Thorfinnsdottir, Lilja Brekke"
-
Absolute Quantification of the Central Carbon Metabolome in Eight Commonly Applied Prokaryotic and Eukaryotic Model Systems
Røst, Lisa Marie; Thorfinnsdottir, Lilja Brekke; Kumar, Kanhaiya; Fuchino, Katsuya; Langørgen, Ida Eide; Bartosova, Zdenka; Kristiansen, Kåre Andre; Bruheim, Per (Peer reviewed; Journal article, 2020)Absolute quantification of intracellular metabolite pools is a prerequisite for modeling and in-depth biological interpretation of metabolomics data. It is the final step of an elaborate metabolomics workflow, with challenges ... -
Establishment of a Standardized Protocol and Assessing the Impact of Growth Phases for Persister Quantification
Brygmann, Elise (Master thesis, 2019)Persister er en subpopulasjon av celler i en bakteriekultur som har lang levetid ved antibiotika behandling. Persisterne oppstår hovedsakelig fra to mekanismer: trigget og spontant. Triggede persistere er et svar på cellulær ... -
Experimental determination of Escherichia coli biomass composition for constraint-based metabolic modeling
Simensen, Vetle; Schulz, Christian; Karlsen, Emil; Bråtelund, Signe; Burgos, Idun Maria Tokvam; Thorfinnsdottir, Lilja Brekke; Garcia Calvo, Laura; Bruheim, Per; Almaas, Eivind (Peer reviewed; Journal article, 2022)Genome-scale metabolic models (GEMs) are mathematical representations of metabolism that allow for in silico simulation of metabolic phenotypes and capabilities. A prerequisite for these predictions is an accurate ... -
Investigating the Role of Stress Responses in Escherichia coli in Persister Formation through Persister Quantification of relA and rpoS null mutants
Trømborg, Åsne Skram (Master thesis, 2021)Bakterier som overlever behandling med antimikrobielle stoffer, er et økende, globalt problem og er estimert å kunne bli årsaken til 10 millioner dødsfall innen 2050 om dagens trend, med høy bruk og lav utvikling av ... -
Metabolic Responses to Colistin Sulfate and Trimethoprim Perturbation in Escherichia coli K12 MG1655
Evensen, Nora Østli (Master thesis, 2022)Antibiotika er antibakterielle molekyler som brukes i behandling mot bakterieinfeksjoner, men grunnet overforbruk og feilbruk har antibiotikaresistens blitt et økende problem. Antibiotikaresistens regnes som en av de største ... -
Optimized Fast Filtration-based Sampling and Extraction Enables Precise and Absolute Quantification of the Escherichia coli Central Carbon Metabolome
Thorfinnsdottir, Lilja Brekke; Garcia Calvo, Laura; Bø, Gaute Hovde; Bruheim, Per; Røst, Lisa Marie Ivarsdatter (Peer reviewed; Journal article, 2023)Precise and accurate quantification is a prerequisite for interpretation of targeted metabolomics data, but this task is challenged by the inherent instability of the analytes. The sampling, quenching, extraction, and ... -
Survival of Escherichia coli after high-antibiotic stress is dependent on both the pregrown physiological state and incubation conditions.
Thorfinnsdottir, Lilja Brekke; Bø, Gaute Hovde; Booth, James Alexander; Bruheim, Per (Journal article; Peer reviewed, 2023) -
Transcriptomic and Metabolomic Analysis of the Escherichia coli Stress Response to Antibiotics With Different Modes of Action
Teigset, Erlend Gløer Stedje (Master thesis, 2022)Antibiotikaresistens er en eksistensiell trussel mot menneskeheten. Kampen mot antimikrobiell resistens krever både utvikling av nye behandlinger og forbedring av eksisterende behandlinger for å gjøre bakterier mer sårbare ...