Show simple item record

dc.contributor.advisorBjørnland, Thea
dc.contributor.authorMæland, Ingrid Langevei
dc.date.accessioned2023-10-10T17:20:26Z
dc.date.available2023-10-10T17:20:26Z
dc.date.issued2023
dc.identifierno.ntnu:inspera:140649151:34431255
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11250/3095605
dc.description.abstractDen norske lakseoppdrettsindustrien står overfor en betydelig utfordring med forekomst av lakselus (Leopeohtheirus salmonis). Lakselusen skader b˚ade villaks og oppdrettslaks ved å redusere vekstraten deres og til slutt for˚arsake deres død. For å takle denne utfordringen eksperimenterer industrien med ulike metoder og driftsmodeller for å få kontroll over utbredelsen av lakselus. I tillegg har norske myndigheter innført forskrifter knyttet til håndtering av lakselus for å minimere de negative konsekvensene av lakselus og fremme etisk og effektiv produksjon av oppdrettslaks. Et mål med denne avhandlingen er å undersøke ulike regresjonsmodeller for telledata ved hjelp av en grunnlinjetellingsvariabel (baseline). I tillegg er vi interessert i å anvende regresjonsmodellene for å studere effekten av ulike ikke-medikamentelle behandlingsmetoder. Til slutt er vi interessert i å gjenoppta studiene gjort i Mæland 2022 om re-smitte av lakselus etter avlusning. I dette prosjektet har utviklingen av lakselus ved 35 ulike lokasjoner i Trøndelag-regionen i perioden mellom 2018 og 2019 blitt studert. Telledataen som er innhentet fra ulike lakseoppdretterier har blitt analysert for å undersøke forekomsten av lakselus. Det registrerte antallet lus er blitt sammenlignet med ulike forklaringsvariabler for å bestemme deres innvirkning p˚a responsvariabelen. For å undersøke de ulike avlusningsmetodene og resmitte av lakselus har vi tilpasset generaliserte lineære modeller, inkludert Poisson- og negativ binomisk regresjonsmodeller, samt multiple lineære og random intercept modeller, til de observerte telledataene. Resultatene fra denne avhandlingen antyder at en multippel lineær og random intercept-modell med en log-transformert responsvariabel synes å være best egnet til å beskrive tellingsdataene for lakselus. Derimot ga Poisson- og negative binomiske modeller en dårlig tilpasning av dataen. Den multiple lineære modellen tydet på at Optilicer behandlingsmetoden presterte bedre enn LiceFlusher -metoden. Dette resultatet var ikke i samsvar med resultatene fra random intercept modellen, som ga ingen indikasjon på at noen av behandlingsmetodene var bedre enn de andre. I studien om re-smitte av lakselus antydet resultatene at sjøtemperatur, gjennomsnittlig vekt på laksen og plassering av laksen etter avlusning var assosiert med re-smitte. Dermed stemte ikke resultatene helt overens med de i Mæland 2022, hvor ogs˚a lakseskjørt var koblet til re-smitte.
dc.description.abstractThe Norwegian aquaculture industry faces a significant challenge with the prevalence of salmon lice. The salmon louse Lepeophtheirus salmonis harm both wild and farmed salmon by reducing their growth rate and ultimately causing their death. To address this issue, the industry is experimenting with various methods and operating models to gain control over the salmon lice. In addition, the Norwegian public authorities have implemented regulations related to lice management to minimize the negative impacts of salmon lice and promote ethical and efficient production of farmed salmon. One objective of this thesis is to investigate different regression models for count data using a baseline count variable. In addition to this, we are interested in applying the regression models to study the effect of the different non-medicinal treatment methods. Finally, we are interested in resuming the studies done in Mæland 2022 on re-infestation of salmon lice after delousing. In this thesis, the development of salmon lice at 35 distinct locations in the Trøndelag region between 2018 and 2019 have been studied. Count data obtained from various salmon farms were analysed to examine the prevalence of salmon lice. The recorded number of salmon lice have been compared to different explanatory variables to determine their impact on the response variable. To investigate the various delousing treatment methods and the re-infestation of salmon lice, generalized linear models including Poisson and negative binomial regression models, and multiple linear and random intercept models have been fitted to the observed count data. The results obtained in the thesis suggests that a multiple linear and random intercept model with a logtransformed response variable seemed to fit the salmon lice count data, while the Poisson and negative binomial models led to a poor model fit. According to the multiple linear model, it appeared that the Optilicer treatment method performed better than the LiceFlusher method, but when adding a random intercept to account for location based clustering, there were no indications that any of the treatment methods were better than the other. In the studies of re-infestation of mobile lice, the results suggested that the temperature of the sea, average weight, and the placement of salmons after delousing was associated with re-infestation. This result did not completely coincide with the results obtained in Mæland 2022, where also lice skirt was associated with reinfestation.
dc.languageeng
dc.publisherNTNU
dc.titleA study of regression models for count data, with applications to salmon lice data
dc.typeMaster thesis


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record