Genekspresjonsanalyse av muc5, muc18 og il4/13a fra gjellevev i atlantisk laks ved bruk av RT-qPCR – før, under og tre uker etter brønnbåttransport

Abstract

Genekspresjon av muciner og interleukiner i kommersiell atlantisk laks kan gi en indikasjon på fiskens helse og velferd. I denne studien blir det sett på fiskens fysiologiske respons på transport fra settefiskanlegg på land til oppdrettsanlegg i sjø. Økt kunnskap om hvordan fiskens fysiologiske respons på en slik transport er, kan danne et viktig grunnlag for fremtidig transport av atlantisk laks i oppdrettsnæringen på en effektiv og minst mulig stressende måte. Denne studien baserer seg på vevsprøver tatt fra laksens gjeller før, under og tre uker etter transport. RT-qPCR ble brukt som analysemetode for tre gener og ett normaliseringsgen, henholdsvis muc5, muc18 og il4/13a, og actb.

Relativ genekspresjon ble bestemt med ΔΔCt- og 2-ΔΔCt-metoden etter bearbeidelse av rådata fra Aligent AriaMx 1.8 i Microsoft Excel. Dataene ble fremstilt grafisk og resultatene viste en oppregulering av de aktuelle genene under transport og tre uker etter transport. Signifikansen ble bestemt ved utførelse av t-test. Oppreguleringen viser at det har skjedd en fysiologisk respons i fisken som følge av transporten. Det anbefales videre forskning rundt de aktuelle genenes funksjon i fisk, for å få en bedre forståelse av hvordan den fysiologiske responsen påvirker fisken.

Gene expression of mucins and interleukins in commercial Atlantic salmon may provide an indication of the health and welfare of the fish. In this study, the physiological response the fish get from transportation from land-based hatcheries to fish farms at sea is discussed. Increased knowledge of the physiological response in fish to such transport, can make an important foundation for future transport of Atlantic salmon in the aquaculture industry. In the future, the main goal should be to make the transport efficient and less stressful. This study is based on tissue samples taken from the gills of salmon before, during and three weeks after transport. RT-qPCR was used as the assay method for three genes and one normalization gene, muc5, muc18, and il4/13a, and actb, respectively.

Relative gene expression was determined by the ΔΔCt- and 2-ΔΔCt-method after processing raw data from Aligent AriaMx 1.8 in Microsoft Excel. The data were presented graphically and showed a significant upregulation of the relevant genes during transport as well as three weeks after transport. The significance was determined by performing a t-test. The upregulation shows that there has been a physiological response in the fish as a result of the transport. Further research on the functions of the relevant genes in fish is recommended, in order to gain a better understanding of how the physiological response affects the fish.