Automatisk oversettelse av pasientjournaler

Et prototype av programvaren i prosjektet ble utviklet av Elena Ivanova (og senere også Ola Vikholt). Dette programmet ble skrevet i PHP og var derfor en web-applikasjon. Med dette programmet kunne man lese journaler som ble lagt inn på forhånd, og både lese forklaringer på ord som ble gjenkjent og legge til nye definisjoner på ord som ikke ble gjenkjent.

Prototypen ble installert på en av IVS' maskiner. Brukernavn og passord til denne maskinen er root og e60breh. Programfilene finnes i /var/www/masterwww4, og dataene er lagret i flere databaser, nel, masterwww og minjournal. Brukernavn og passord for disse er root og bjarne.

Brukernavn og passord for å logge inn i programmet er admin og e60breh.

Fordi dette var et program utviklet i forbindelse med en masteroppgave, ble det ikke lagt stor vekt på integrasjon med sykehusets EPJ, skalerbarhet eller sikkerhet. Derfor begynte vi å utvikle en ny arkitektur som tok hensyn til disse tingene og samtidig være mer fleksibel.

De journalene som ligger i programmet er hentet ut av Datacor, EPJ-systemet som før ble brukt på Torakskirurgisk avdeling, og som delvis blir brukt på Intervensjonssenteret i dag. Journalene ble hentet ut av dette systemet manuelt ved å skrive ut journalnotater til en virtuell printer og så trekke ut selve journalteksten av dette dokumentet.

DocuLive er pasientjournalsystemet som Rikshospitalet bruker i dag, og er utviklet av Siemens. Systemet er basert på papirjournalen, dvs. at det finnes hundrevis av forskjellige dokumenttyper som hver inneholder flere felter. Dokumenttypene er kategorisert ut ifra en formalisert standard.

DocuLive lagrer pasientinformasjon og inneholder en adgangskontroll som gjør at kun helsepersonell som har med pasienten å gjøre, kan lese en pasients journal.

DocuLive består av to deler, en server og en klient. Sykehuset drifter serveren(e) sentralt, og klientene brukes av klinisk personell. DocuLive bruker MS SQL Server for å lagre informasjonen i systemet. Denne databasen er lukket og kan bare leses/skrives gjennom DocuLive. Det er imidlertid mulig å lage eksterne klienter som kommuniserer med DocuLive server over .NET WebServices (SOAP over HTTP).

Dokumentasjonen av DocuLive.NET WebServices finnes på http://www.doculive.net/WebServices.aspx

Ola Vikholt og Vegard Nossum har vært i kontakt med Bjørnar S. Haugland som jobber på IT-avdelingen, for å få en lokal installasjon av siste versjon av DocuLive server og klient med Microsoft SQL Server og DocuLive WebServices .NET som kan brukes til å eksperimentere med WebServices. Dette er fullt mulig, men foreløpig finnes det ikke noe sted å plassere denne maskinen, som må være en RH-klient koblet til RH-nettet.

NEL er en medisinsk ordbok som inneholder forklaringer på medisinske termer. NEL finnes i papirutgave og nettutgave. NEL har derimot ingen stavekontroll, og kan ikke gjøre oppslag på flere ord i en tekst.

Intervensjonssenteret har tillatelse til å bruke NEL i dette prosjektet.

http://www.legehandboka.no/

Felleskatalogen er et register over alle preparater som selges i Norge. Dette registeret inneholder pakningsvedleggene til disse preparatene. Ved å hente ut navn på og en kort beskrivelse av hvert preparat, kan vi forklare også disse ordene dersom de forekommer i journalen, og samtidig gi pasienten direkte tilgang på pakningsvedlegget til dette preparatet.

Intervensjonssenteret har tillatelse til å bruke Felleskatalogen i dette prosjektet.

“Felleskatalogen nedlastbar web” kan lastes ned fra http://www.felleskatalogen.no/tjenester med brukernavn fk-web og passord fk-web. Vår kontaktperson hos Felleskatalogen er Ole-Kristian Setnes <OleK.Setnes@lmi.no>.

http://www.felleskatalogen.no/

Intervensjonssenteret vil gjerne gjøre en klinisk studie som viser om systemet gir pasienten en bedre erfaring ved opphold på sykehuset og ved lesing av journalen. Det er allerede søkt regional-etisk komité, og tillatelse til å gjøre studien er gitt. Intervensjonssenteret har også bedt omkring 300 (?) toraks-pasienter om tillatelse til å bruke deres journal i prosjektet. Disse svarene kan finnes i tre permer markert “MinJournal 2006 - Svar fra pasienter ang. bruk av journal”.

For å opprette en ny MySQL-database, følg instruksjonene i MySQL-instruksjonsmanualen (http://dev.mysql.com/doc/).

# For the command-line client
[client]
user=root
password=
database=minjournal2

# For the thesaurus application
[minjournal]
user=root
password=
database=minjournal2

For å gjøre det lett å installere prototypen på andre maskiner, har vi valgt å lage øyeblikksbilder av filsystemet til den originale maskinen. Disse øyeblikksbildene er kun lesbare, men mange programmer (inkludert MySQL og PHP) må ha skrivetilgang til noen av filene. Derfor må bildene monteres og så kopieres til et område som også kan skrives til. Nedenfor vises framgangsmåten for kopiere bildene til en midlertidig mappe (tmpfs) i RAM. Det vil det også være mulig å gjøre dette med unionfs, da også mer effektivt.

Når prototypen er installert, kan den gjøes tilgjengelig ved å gå inn på http://localhost/.